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Hola Albert, gracias por contestar. Comentaba en mi duda que la versión es la V16 CE. Y aparte, amplié la info contestándome a mí mismo (debería haber editado mi pregunta en vez de hacer eso) indicando que la factura de proveedor original es un DUA que parece que se tuvo que cancelar. Es probable que no se esté contemplando esta casuística por lo atípico de la situación. Es algo sobre lo que se propuso este pull: https://github.com/OCA/l10n-spain/pull/3022 para V14 pero creo que no se llegó a implementar.

perdona 16CE, correcto, pues veo que Eric lo comentó para v14 y aplicó dicho PR, si es un caso puntual o haces una migración de dicho módulo a v16 o bien tienes la opción "no elegante" de hacerlo en odoo, da error, y luego ir a aeat y subirlo manualmente.
Ahora que pienso, si es una rectificativa del DUA, y si fuera del mismo periodo, si cancelas la original en el SII y no está presentada ni la original de compra ni la rectificativa, ¿te lo solucionaria?
como comento... son soluciones no elegantes, lo correcto sería migrar dicho módulo, pero si te ayudan o guian un poco a la solución, perfecto

Muchas gracias Albert de nuevo.